В первое время больных лечили доступными на тот момент средствами, которые были малоэффективны.
Но когда к 1947 году в США стандартным лекарством против сифилиса стал пенициллин, пациентам в Таскиги специально об этом не сообщили — более того, учёные организовали недопущение их лечения в других больницах.
Программа была свёрнута только в 1972 году, когда информация о ней была опубликована в прессе, и к этому времени многие участники исследований умерли от сифилиса или его осложнений.