Его главной идеей стало создание закрытого однородного общества, для чего были практически полностью ограничены въезд и выезд из страны, а также ввоз иностранных товаров.
Испаноязычному населению запретили заключать браки друг с другом, предписав жениться и выходить замуж за местных индейцев гуарани, чернокожих или мулатов, причём все браки регистрировал лично Франсия.
Он правил страной более 25 лет до самой смерти.